这个问题适合用“输入、执行、证据”三层来判断。第一条规则是：应把真正承担任务和版本控制的目录设为主要范围。
在真实项目里，多个目录并列时，自动发现配置与Git操作通常有主次差异。如果只看聊天中的完成说明，而不检查文件和命令证据，问题很容易被带到下一阶段。
从官方文档能够确认的不是保证结果的秘诀，而是运行条件。Codex IDE扩展适合围绕编辑器中打开的文件和符号做聚焦修改，同时仍应通过仓库搜索确认依赖关系。
可以按最小步骤执行：确认每个目录用途，把主仓库作为启动点，其他资料作为只读上下文。每一步保留命令、版本和结果，任何一步异常都先停在当前层定位。
建议在修改前记录基线，修改后用同样条件检查Git状态、指令发现和搜索范围是否符合预期。如果输入不同，就把结果当作线索而不是对照。
如果本题还有安装页、错误页和案例页，可让当前文章承担主问题解释，再通过描述性锚文本连接下一步，避免多个页面争夺相同查询。
为了让Codex多目录项目能够被另一位成员复现，任务记录至少包含四个检查点：PRIMARY、SECONDARY、GIT、SCOPE。这些英文标签也可用于分支、日志或看板检索。
一次合格复盘要同时回答两件事：是否做到“检查Git状态、指令发现和搜索范围是否符合预期”，以及是否出现“把备份目录设为主目录可能在错误副本上修改”。前者决定是否继续，后者决定是否暂停、回滚或补充授权。
对非技术用户，交付说明应把“已修改文件”“已执行检查”“尚未验证事项”分开写，避免把技术日志当成最终结果。
最后不要忽略人的判断。把备份目录设为主目录可能在错误副本上修改。Codex可以执行和验证，但不能代替业务负责人决定范围与风险承受度。